LymphoSign: kit CE/IVD para a classificação de linfomas não Hodgkin
O linfoma não Hodgkin é um tipo de câncer que se origina no sistema linfático, que faz parte do sistema imunológico. É caracterizado pelo crescimento anormal de linfócitos, um tipo de glóbulo branco, e pode ocorrer em qualquer parte do corpo.
Existem mais de 80 tipos de linfoma não Hodgkin, alguns dos quais são raros e difíceis de caracterizar. O conhecimento preciso tornou-se uma questão chave.
Muitos avanços foram feitos desde a introdução da classificação da OMS em 2001. No entanto, o risco de erros permanece maior do que em outras patologias.
O test LymphoSign oferece uma classificação detalhada desses linfomas. É um método de ponta para avaliar o estágio de diferenciação em células tumorais de linfoma não Hodgkin (LNH). Ao aproveitar os níveis de expressão de RNA de mais de 130 marcadores genéticos relevantes, esta solução fornece insights valiosos sobre a progressão da doença.
Subtipos de linfoma não Hodgkin
Linfoma não Hodgkin de células B de alto grau
- DLBCL ABC
- DLBCL GCB
- DLBCL PMBL
Linfoma não Hodgkin de células B de baixo grau
- Linfoma folicular (FL)
- Linfoma de células do manto (MCL)
- Linfoma de zona marginal (MZL)
- Linfoma linfocítico pequeno (SLL)
Linfoma não Hodgkin de células T
- Linfoma T angioimunoblástico (AITL)
- Linfoma anaplásico de grandes células ALK-positivo (ALCL ALK+)
- Linfoma anaplásico de grandes células ALK-negativo citotóxico (ALCL ALK- cytotox)
- Linfoma anaplásico de grandes células ALK-negativo Th2 (ALCL ALK- Th2)
- Leucemia-linfoma de células T do adulto (ATLL)
- Linfoma NK/T-cell (NKTCL)
Características do teste
LymphoSign é um teste inovador, preciso e confiável para patologistas e biólogos moleculares. Este teste é usado para caracterizar linfomas não Hodgkin (LNH).
Ele avalia o grau de diferenciação das células tumorais analisando o nível de expressão de mais de 130 marcadores genéticos relevantes, baseado na tecnologia de PCR dependente de ligação (RT-MLPSeq).
A simplicidade do teste permite obter resultados em 24 horas a partir de RNA tumoral. O protocolo é otimizado para amostras de baixa qualidade, como amostras FFPE.
Usando inteligência artificial treinada em um banco de dados com mais de 3.000 casos, a plataforma RT-MIS estabelece a classificação mais provável entre 13 subtipos de LNH de células B e T.
O que é RT-MLPSeq?Características principais do protocolo
Preparação da amostra
- Nenhuma purificação necessária até a preparação da biblioteca, minimizando a perda de material e mantendo alta sensibilidade.
- Sequências genéticas curtas direcionadas (40-60 bases), garantindo robustez contra degradação de RNA.
- Particularmente adequado para analisar amostras biológicas difíceis, como biópsias de tecido fixadas em parafina.
Sequenciamento
- 10⁵ sequências por amostra suficientes para perfis de expressão analisáveis, permitindo análise de alto rendimento.
- Bibliotecas podem ser carregadas simultaneamente com outras bibliotecas de sequenciamento, otimizando a eficiência de custo.
Análise
- Uma vez concluído o sequenciamento, o arquivo FASTQ pode ser carregado na plataforma RT-MIS.
- Após alguns minutos de análise, um relatório com a assinatura de expressão de vários genes e uma classificação prevista por IA de acordo com a classificação da OMS de 2017 é fornecido.
Especificações técnicas
| Duração de manipulação | ≃4 horas |
|---|---|
| Tempo de trabalho real | ≃1 a 1,5 horas |
| Tipo de ácido nucleico | RNA |
| Quantidade de entrada | Entre 50 e 500 ng de RNA em um volume de 2 µl |
| Tipo de câncer | Linfoma não Hodgkin |
| Conteúdo do kit de reagentes | Sondas direcionadas a 137 marcadores, códigos de barras, primers de sequência |
| Método | RT-PCR dependente de ligação |
| Descrição | Compare os perfis de expressão obtidos de genes, mutações somáticas ou translocações cromossômicas com aqueles dos principais tipos de linfoma não Hodgkin. |
| Compatibilidade de equipamentos | MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 Illumina® |
| Tipo de amostras | Biópsias de tecido em temperatura ambiente, congeladas ou fixadas e incluídas em parafina |
| Tecnologia | Sequenciamento de nova geração |
Principais características e benefícios
Kits disponíveis
Recursos
Publicações
-
High PDL1/PDL2 gene expression correlates with worse outcome in primary mediastinal large B-cell lymphoma
Vincent Camus et al., Blood Advances, December 12, 2023
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Integrative diagnosis of primary cutaneous large B-cell lymphomas supports the relevance of cell of origin profiling
Audrey Gros et al., PLoS One, April 22, 2022
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Circulating tumor DNA in primary mediastinal large B-cell lymphoma versus classical Hodgkin lymphoma
Vincent Camus et al., Leukemia & Lymphoma, April 2022
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Defining signatures of peripheral T-cell lymphoma with a targeted 20-marker gene expression profiling assay
Fanny Drieux et al., Haematologica, June 2020
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Combining gene expression profiling and machine learning to diagnose B-cell non-Hodgkin lymphoma
Victor Bobée et al., Blood Cancer Journal, May 22, 2020
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LymphoSign Test-Kit
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