LymphoSign: kit CE/IVD para la clasificación de linfomas no Hodgkin
El linfoma no Hodgkin es un tipo de cáncer que se origina en el sistema linfático, que forma parte del sistema inmunitario. Se caracteriza por el crecimiento anormal de linfocitos, un tipo de glóbulos blancos, y puede ocurrir en cualquier parte del cuerpo.
Existen más de 80 tipos de linfoma no Hodgkin, algunos de los cuales son raros y difíciles de caracterizar. El conocimiento preciso se ha convertido en un problema clave.
Se han logrado muchos avances desde la introducción de la clasificación de la OMS en 2001. Sin embargo, el riesgo de errores sigue siendo mayor que en otras patologías.
La prueba LymphoSign ofrece una clasificación detallada de estos linfomas. Es un método de vanguardia para evaluar el estadio de diferenciación en las células tumorales del linfoma no Hodgkin (LNH). Al aprovechar los niveles de expresión de ARN de más de 130 marcadores genéticos relevantes, esta solución proporciona valiosos conocimientos sobre la progresión de la enfermedad.
Subtipos del linfoma no Hodgkin
Linfoma no Hodgkin de células B de alto grado
- DLBCL ABC
- DLBCL GCB
- DLBCL PMBL
Linfoma no Hodgkin de células B de bajo grado
- Linfoma folicular (FL)
- Linfoma de células del manto (MCL)
- Linfoma de zona marginal (MZL)
- Linfoma linfocítico pequeño (SLL)
Linfoma no Hodgkin de células T
- Linfoma T angioinmunoblástico (AITL)
- Linfoma anaplásico de grandes células ALK-positivo (ALCL ALK+)
- Linfoma anaplásico de grandes células ALK-negativo citotóxico (ALCL ALK- cytotox)
- Linfoma anaplásico de grandes células ALK-negativo Th2 (ALCL ALK- Th2)
- Leucemia-linfoma de células T del adulto (ATLL)
- Linfoma NK/T-cell (NKTCL)
Características de la prueba
LymphoSign es una prueba innovadora, precisa y confiable para patólogos y biólogos moleculares. Esta prueba se utiliza para caracterizar linfomas no Hodgkin (LNH).
Evalúa el grado de diferenciación de las células tumorales analizando el nivel de expresión de más de 130 marcadores genéticos relevantes, basado en la tecnología de PCR dependiente de ligación (RT-MLPSeq).
La simplicidad de la prueba permite obtener resultados en 24 horas a partir de ARN tumoral. El protocolo está optimizado para muestras de baja calidad como muestras FFPE.
Utilizando inteligencia artificial entrenada en una base de datos de más de 3.000 casos, la plataforma RT-MIS establece la clasificación más probable entre 13 subtipos de LNH de células B y T.
¿Qué es RT-MLPSeq?Características clave del protocolo
Preparación de la muestra
- No se requiere purificación hasta la preparación de la biblioteca, minimizando la pérdida de material y manteniendo una alta sensibilidad.
- Secuencias genéticas cortas dirigidas (40-60 bases), asegurando robustez contra la degradación del ARN.
- Particularmente adecuada para analizar muestras biológicas difíciles como biopsias de tejido fijadas en parafina.
Secuenciación
- 10⁵ secuencias por muestra suficientes para perfiles de expresión analizables, permitiendo un análisis de alto rendimiento.
- Las bibliotecas pueden cargarse simultáneamente con otras bibliotecas de secuenciación, optimizando la eficiencia de costos.
Análisis
- Una vez completada la secuenciación, el archivo FASTQ puede cargarse en la plataforma RT-MIS.
- Después de unos minutos de análisis, se proporciona un informe con la firma de expresión de varios genes y una clasificación predicha por IA según la clasificación de la OMS de 2017.
Especificaciones técnicas
| Duración de manipulación | ≃4 horas |
|---|---|
| Tiempo de trabajo real | ≃1 a 1,5 horas |
| Tipo de ácido nucleico | ARN |
| Cantidad de entrada | Entre 50 y 500 ng de ARN en un volumen de 2 µl |
| Tipo de cáncer | Linfoma no Hodgkin |
| Contenido del kit de reactivos | Sondas que dirigen 137 marcadores, códigos de barras, cebadores de secuencia |
| Método | RT-PCR dependiente de ligación |
| Descripción | Compare los perfiles de expresión obtenidos de genes, mutaciones somáticas o translocaciones cromosómicas con los de los principales tipos de linfoma no Hodgkin. |
| Compatibilidad de equipos | MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 Illumina® |
| Tipo de muestras | Biopsias de tejido a temperatura ambiente, congeladas o fijadas e incluidas en parafina |
| Tecnología | Secuenciación de nueva generación |
Características y beneficios clave
Kits disponibles
Recursos
Publicaciones
-
High PDL1/PDL2 gene expression correlates with worse outcome in primary mediastinal large B-cell lymphoma
Vincent Camus et al., Blood Advances, December 12, 2023
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Integrative diagnosis of primary cutaneous large B-cell lymphomas supports the relevance of cell of origin profiling
Audrey Gros et al., PLoS One, April 22, 2022
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Circulating tumor DNA in primary mediastinal large B-cell lymphoma versus classical Hodgkin lymphoma
Vincent Camus et al., Leukemia & Lymphoma, April 2022
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Defining signatures of peripheral T-cell lymphoma with a targeted 20-marker gene expression profiling assay
Fanny Drieux et al., Haematologica, June 2020
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Combining gene expression profiling and machine learning to diagnose B-cell non-Hodgkin lymphoma
Victor Bobée et al., Blood Cancer Journal, May 22, 2020
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