O teste SarcomaFusion contém sondas específicas para os parceiros esquerdo e direito dos transcritos de fusão descritos na literatura associados a sarcomas.
Diagnóstico de sarcoma numa única reação
Transcritos de fusão são encontrados em aproximadamente um terço dos tumores de tecidos moles, e até o momento, a literatura descreveu mais de 210 fusões. Eles estão frequentemente associados a um subtipo histológico particular e, consequentemente, a tratamentos específicos. Assim, constituem marcadores moleculares diagnósticos ideais.
A detecção desses transcritos de fusão é essencial para o manejo do paciente.
O teste SarcomaFusion permite a detecção de transcritos de fusão identificados em sarcomas em um único teste.
Este teste é marcado CE-IVD para uso diagnóstico in vitro, garantindo conformidade com os requisitos europeus de segurança e desempenho.
Exemplos de Transcritos de Fusão
Rabdomiossarcoma Alveolar
- Fusões PAX3::FOXO1 e PAX3::NCOA1
- Tratamentos possíveis:
- Quimioterapia
- Pazopanib (PDGFa, VEGF-1)
- Sorafenib (PDGFR, VEGFR, MAPK)
- Crizotinib (MET, ALK, ROS1)
- Temsirolimus (mTOR)
- Cixutumumab (IGF-1R)
- Radioterapia
Sarcoma de Ewing
- Fusões EWSR1::FLI1, EWSR1::ETV1, EWSR1::FEV e outros parceiros de EWSR1
- Tratamentos possíveis:
- Cirurgia
- Quimioterapia
- Radioterapia
- Terapia com células CAR-T
Hemangioma Epitelioide
- Fusão ACTB::FOSB
- Tratamentos possíveis:
- Cirurgia
- Quimioterapia
- Radioterapia
Características do Teste
SarcomaFusion é um teste único, altamente robusto e sensível projetado para patologistas e biólogos moleculares.
Baseado na tecnologia de PCR dependente de ligação (RT-MLPSeq), este teste permite a detecção de transcritos de fusão de amostras frescas, congeladas ou embebidas em parafina, entre 210 fusões possíveis em uma única reação.
A simplicidade do teste permite obter resultados em 24 horas a partir de RNA tumoral. Além disso, a quantidade mínima de RNA tumoral necessária significa que uma biópsia por agulha é suficiente para obter resultados.
O SarcomaFusion inclui um controle GAPDH para garantir o sucesso do procedimento.
O que é RT-MLPSeq?Lista de Sondas
Características Principais do Protocolo
Teste In Vitro
- Quatro passos principais
- Meio dia, incluindo 1 a 1,5 horas de manipulação real
- Alta sensibilidade devido a sondas curtas
- Otimizado para amostras FFPE
Sequenciação
- Compatível com tecnologia Illumina
- Sequenciação com outras bibliotecas possível
- Apenas 100.000 leituras necessárias por amostra
Análise
- Maior especificidade devido a UMIs
- Análise bioinformática incluída
- Acesso a todos os dados brutos

Especificações Técnicas
| Tipo de Câncer | Sarcomas |
|---|---|
| Domínio de Aplicação | Detecção de transcritos de fusão |
| Duração do Procedimento | Aproximadamente 5,5 horas (excluindo sequenciação) |
| Tempo de Trabalho Real | Aproximadamente 1 a 1,5 horas (excluindo sequenciação) |
| Tipos de Amostras | Biópsias de tecido fresco, congelado ou fixado e embebido em parafina |
| Quantidade de Entrada | Entre 50 e 500 ng de RNA em um volume de 2,5 µL |
| Conteúdo de Reactivos | Sondas direcionadas a mais de 210 transcritos de fusão, códigos de barras, primers de sequenciação |
| Compatibilidade de Equipamento | Sequenciadores Illumina® |
| Análise Bioinformática | Acesso à plataforma de análise RT-MIS incluído |
| Dados Acessíveis | Representação gráfica de transcritos de fusão detectados, bibliografia associada e dados brutos completos (CSV) |
Composição do Kit
Conteúdo do Kit:
- Mistura de sondas RT-MLPA
- Códigos de barras Genexpath
- Códigos de barras de controle GAPDH da Genexpath
- Primers de sequenciação
Disponível em 8, 16, 24 ou 48 análises
Resultados Obtidos
Uma vez que o seu ficheiro FASTQ é carregado na plataforma, o RT-MIS realiza a desmultiplexagem e detecção de transcritos de fusão. Resultados positivos são exibidos da seguinte forma:
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Recursos
Publicações Relacionadas com o Teste SarcomaFusion
-
Detecção de Fusões de Sarcoma por um Ensaio de RT-PCR Multiplex Dependente de Ligação Baseado em Sequenciação de Nova Geração
Lanic et al., Mod Pathol. 2022
Ler a Publicação
PMID: 35075283

