Diagnóstico de sarcoma numa única reação

SarcomaFusion: Teste Diagnóstico Molecular para Sarcomas

Transcritos de fusão são encontrados em aproximadamente um terço dos tumores de tecidos moles, e até o momento, a literatura descreveu mais de 210 fusões. Eles estão frequentemente associados a um subtipo histológico particular e, consequentemente, a tratamentos específicos. Assim, constituem marcadores moleculares diagnósticos ideais.

A detecção desses transcritos de fusão é essencial para o manejo do paciente.

O teste SarcomaFusion permite a detecção de transcritos de fusão identificados em sarcomas em um único teste.

Este teste é marcado CE-IVD para uso diagnóstico in vitro, garantindo conformidade com os requisitos europeus de segurança e desempenho.

Exemplos de Transcritos de Fusão

Rabdomiossarcoma Alveolar

  • Fusões PAX3::FOXO1 e PAX3::NCOA1
  • Tratamentos possíveis:
    • Quimioterapia
    • Pazopanib (PDGFa, VEGF-1)
    • Sorafenib (PDGFR, VEGFR, MAPK)
    • Crizotinib (MET, ALK, ROS1)
    • Temsirolimus (mTOR)
    • Cixutumumab (IGF-1R)
    • Radioterapia

Sarcoma de Ewing

  • Fusões EWSR1::FLI1, EWSR1::ETV1, EWSR1::FEV e outros parceiros de EWSR1
  • Tratamentos possíveis:
    • Cirurgia
    • Quimioterapia
    • Radioterapia
    • Terapia com células CAR-T

Hemangioma Epitelioide

  • Fusão ACTB::FOSB
  • Tratamentos possíveis:
    • Cirurgia
    • Quimioterapia
    • Radioterapia

Características do Teste

SarcomaFusion é um teste único, altamente robusto e sensível projetado para patologistas e biólogos moleculares.

Baseado na tecnologia de PCR dependente de ligação (RT-MLPSeq), este teste permite a detecção de transcritos de fusão de amostras frescas, congeladas ou embebidas em parafina, entre 210 fusões possíveis em uma única reação.

A simplicidade do teste permite obter resultados em 24 horas a partir de RNA tumoral. Além disso, a quantidade mínima de RNA tumoral necessária significa que uma biópsia por agulha é suficiente para obter resultados.

O SarcomaFusion inclui um controle GAPDH para garantir o sucesso do procedimento.

O que é RT-MLPSeq?

Lista de Sondas

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O teste SarcomaFusion contém sondas específicas para os parceiros esquerdo e direito dos transcritos de fusão descritos na literatura associados a sarcomas.

Características Principais do Protocolo

Teste In Vitro

  • Quatro passos principais
  • Meio dia, incluindo 1 a 1,5 horas de manipulação real
  • Alta sensibilidade devido a sondas curtas
  • Otimizado para amostras FFPE

Sequenciação

  • Compatível com tecnologia Illumina
  • Sequenciação com outras bibliotecas possível
  • Apenas 100.000 leituras necessárias por amostra

Análise

  • Maior especificidade devido a UMIs
  • Análise bioinformática incluída
  • Acesso a todos os dados brutos
SarcomaFusion Visual

Especificações Técnicas

Tipo de Câncer Sarcomas
Domínio de Aplicação Detecção de transcritos de fusão
Duração do Procedimento Aproximadamente 5,5 horas (excluindo sequenciação)
Tempo de Trabalho Real Aproximadamente 1 a 1,5 horas (excluindo sequenciação)
Tipos de Amostras Biópsias de tecido fresco, congelado ou fixado e embebido em parafina
Quantidade de Entrada Entre 50 e 500 ng de RNA em um volume de 2,5 µL
Conteúdo de Reactivos Sondas direcionadas a mais de 210 transcritos de fusão, códigos de barras, primers de sequenciação
Compatibilidade de Equipamento Sequenciadores Illumina®
Análise Bioinformática Acesso à plataforma de análise RT-MIS incluído
Dados Acessíveis Representação gráfica de transcritos de fusão detectados, bibliografia associada e dados brutos completos (CSV)

Composição do Kit

Kit Example

Conteúdo do Kit:

  • Mistura de sondas RT-MLPA
  • Códigos de barras Genexpath
  • Códigos de barras de controle GAPDH da Genexpath
  • Primers de sequenciação

Disponível em 8, 16, 24 ou 48 análises

Resultados Obtidos

First Page of SarcomaFusion Report

Uma vez que o seu ficheiro FASTQ é carregado na plataforma, o RT-MIS realiza a desmultiplexagem e detecção de transcritos de fusão. Resultados positivos são exibidos da seguinte forma:

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Recursos

Publicações Relacionadas com o Teste SarcomaFusion

  • Detecção de Fusões de Sarcoma por um Ensaio de RT-PCR Multiplex Dependente de Ligação Baseado em Sequenciação de Nova Geração

    Lanic et al., Mod Pathol. 2022
    PMID: 35075283

    Ler a Publicação External Link Icon

Vídeos de Formação

Fusion Transcripts In Vitro Test Implementation

Implementação do Teste In Vitro de Transcritos de Fusão

Library Preparation

Preparação de Bibliotecas para Testes LymphoSign e SarcomaFusion

Sequencing Launch

Lançamento de Sequenciação