O ADN verde de metilo mancha, mas não é um corante específico de ADN. Utilizado sozinho em células inteiras, mancha quase tudo e em particular a parede pectocelulósica. Para aumentar a sua aparente especificidade, deve ser utilizado com um corante complementar.

No núcleo, a cromatina é corada com verde de metilo enquanto os nucléolos são fortemente corados com pironina. A cromatina corresponde aos cromossomas interfásicos, um dos quais é o ADN. Ao nível dos nucléolos (sem membrana) são reunidas muitas moléculas de RNA. Estas são moléculas de RNA que são sintetizadas e montadas em subunidades ribossómicas ao nível dos nucléolos.

O citoplasma é também corado por pironina. As praias cor-de-rosa correspondem a áreas ricas em rRNA, sendo a participação de outros RNAs (tRNA e mRNA) na coloração praticamente anedótica.