A perforina é uma proteína formadora de poros com um mecanismo de formação de canais transmembrana semelhante ao C9, tendo sido demonstrada a homologia entre a perforina e o C9. A perforina encontra-se nos grânulos de linfócitos T citotóxicos e células naturais assassinas, que funcionam para permitir que os granzimos entrem nas células alvo e activem a apoptose. A expressão da perforina é upregulada nas células T CD8+ activadas, e estas células foram identificadas como tendo uma grande influência nas doenças inflamatórias da pele associadas ao Th1. Tem sido sugerido que a perforina desempenha um papel na aloimunidade, estando envolvida tanto no processo citolítico de rejeição como na desregulação das respostas mediadas por células T associadas à resposta aloimune. A citotoxicidade mediada pela perforina também tem sido associada a uma série de doenças auto-imunes. Os defeitos no gene da perforina causam a linfohistiocitose hemofagocítica familiar tipo 2 (HPLH2), uma doença autossómica recessiva rara e letal da primeira infância.