El ADNc de rata (ADN complementario) es una copia de ADN de moléculas de ARN derivadas de muestras biológicas de Rattus norvegicus y generadas mediante transcripción inversa. Dado que el ADNc se deriva del ARN y no del ADN genómico, proporciona información de secuencia correspondiente a los transcritos presentes en la muestra inicial, incluidas las regiones codificantes de transcritos codificantes de proteínas y las secuencias de ARN no codificantes. El ADNc se utiliza ampliamente en biología molecular para el análisis de expresión génica, la caracterización de transcritos, la secuenciación y la clonación.

Los estudios del transcriptoma de rata han identificado una sustancial diversidad de transcritos asociada a tejidos y un procesamiento alternativo del ARN, lo que respalda el uso de recursos de ADNc de rata para la investigación de transcritos y genómica funcional. Sin embargo, la representación del ADNc puede verse influida por el input de ARN, la selección de cebadores, la actividad de la transcriptasa inversa y otros factores experimentales, por lo que no debe considerarse una representación cuantitativa exacta de la población de ARN original.

Características clave

• Secuencia específica de rata : Derivada de ARN de Rattus norvegicus para estudios moleculares específicos de especie.

• Representación de transcritos : Proporciona copias de ADN de secuencias derivadas de ARN y puede respaldar el análisis de la estructura de transcritos, variantes de empalme y diversidad de transcritos.

• Compatibilidad con biología molecular : Aplicable a la amplificación por PCR, secuenciación, clonación y otros flujos de trabajo basados en ADN.

• Acceso a secuencias codificantes : Puede proporcionar secuencias de regiones codificantes de transcritos codificantes de proteínas para estudios moleculares y funcionales posteriores.

Usos habituales de investigación

• Análisis de expresión génica : El ADNc se utiliza comúnmente como plantilla para RT-qPCR y flujos de trabajo relacionados de cuantificación de transcritos.

• Análisis de transcritos e isoformas : Apoya la investigación de la estructura de transcritos, el empalme alternativo y la diversidad de transcritos.

• Clonación y expresión génica : Permite el aislamiento o la clonación de secuencias codificantes para la caracterización funcional y estudios de expresión proteica heteróloga.

• Secuenciación y transcriptómica : El ADNc se utiliza como intermediario en muchos flujos de trabajo de preparación de bibliotecas de RNA-seq y transcriptoma, aunque algunos enfoques de secuenciación utilizan la secuenciación directa de ARN.