As sondas de enumeração de cromossomas são concebidas para identificação e enumeração de cromossomas humanos em células interfásicas e como coadjuvante do cariotipado padrão em metafases. Estas sondas produzirão sinais nítidos e brilhantes específicos para cada cromossoma individual. 

Como vários cromossomas partilham as mesmas sequências repetitivas resultando em sinais de hibridação cruzada, não podem ser diferenciados por sondas centrómeros específicos. Em vez disso, estes cromossomas podem ser identificados através da hibridação directa de sondas específicas rotuladas em proximidade das respectivas sequências de ADN de satélite ou de outros loci específicos dos cromossomas.

A Sonda 2q11 é específica para a região genética AFF3 (família AF4/FMR2, membro 3) em 2q11.2. Devido às hibridizações cruzadas dos satélites do cromossoma 2 alfa para outras regiões centrómicas, as sondas específicas para 2q11 são frequentemente utilizadas para a detecção do número de cópias do cromossoma 2.